前回の記事では、シングルセル解析の結果を格納するためのデータベース（RDB）のテーブル設計を行いました。 本記事では、実際にRDBにデータを格納して、そのデータをSQLクエリで取得するところまでを行います。 テーブル設計のおさらい まずは、前回作成し…

データサイエンティストに求められるスキルとして、データベースを活用したデータハンドリング技術が挙げられます。これはビッグデータ解析を行う上ではExcelでは行数不足が起こり得るということもありますし、何より全てのデータがメモリに収まりきらないこ…

学術論文では、バイオインフォマティクスなどの解析ツールはPythonやRなどで作成され、そのソースコードがそのまま公開されることが多いです。このとき、自分がPythonなどを扱えるなら問題ないのですが、これまでプログラミング言語に触れたことが無い人にと…

老化組織と若年組織の違いとして、細胞数の比率の違いが挙げられます。例えば、老年マウスでは加齢に伴い脂肪組織マクロファージのサブタイプ組成が変化することが知られており、炎症を誘発することが分かっています。このように、老人と若者の生物学的違い…

Pythonでグラフを描くなら、Matplotlibの使用は避けて通れません。「Python グラフ」などで調べると、ほぼ確実にplt.plotなどMatplotlibの関数を見ることになるでしょう。 しかし、いざMatplotlibを使ってみようとしても、思ったように動作しないことが多い…

ブログがどれくらい読まれているかは、はてなブログの場合はアクセス解析ページを見ることで、確認できます。このアクセス解析ページでは、日ごとのアクセス数などがグラフ化されているので、何か分析ツールを用意しなくてもある程度の視覚化は済んでいます…